Четвёртая героиня нашей выпускной серии — Ксения Мартынова! — 11 июня 2026 г. в 10:30:01.898
Четвёртая героиня нашей выпускной серии — Ксения Мартынова! Бакалавриат, направление «Прикладные математика и физика», профиль «Биоинформатика». 🔬 Тема дипломной работы: «Алгоритм расчета функциональной близости белков на основе Генной Онтологии и сетей взаимодействия» 👨🔬 Научный руководитель: Яков Иванович Мокин— выпускник Алгоритмической биоинформатики Академического университета, сотрудник Института Цитологии РАН (группа биоконденсатов и немембранных органелл клетки), а также директор школы дополнительного образования А5. 🧠 Почему это круто? Алгоритм помогает интерпретировать большой объём биологических данных — например, после enrichment-анализа белковой группы, которая предположительно объединена общими функциями. Это важно, потому что помогает приблизиться к пониманию причин неизлечимых заболеваний. Что сделала Ксения: "Мы проанализировали существующие методы работы с терминами Генной Онтологии, используя их достоинства, построили новый алгоритм. Он основан на стратегии жадного отбора, учитывает сложную иерархическую структуру GO и позволяет регулировать количество и специфичность выделяемых функциональных областей под конкретную задачу исследователя." Итог: После применения к настоящим данным, состоящим из 627 обогащенных GO-терминов, список сжался до 85 локальных наименьших общих предков, из которых, управляя гиперпараметрами, мы выделили ключевые клеточные структуры, связанные с патогенезом атаксии. Полученные термины отражают ключевые структуры и процессы, важные для нейродегенеративных заболеваний. Подход можно использовать для интерпретируемого функционального анализа в протеомных и транскриптомных исследованиях, а также для интеграции с данными о белок-белковых взаимодействиях. 🏆 Достижения Ксении: 🔹Работает одновременно в двух институтах: в Институте прикладной астрономии и в Институте цитологии РАН (уже во время учёбы!). 🔹Активный общественный деятель: состоит в студенческом совете, целый год была заместителем председателя. 🔹Ездила на Весеннюю школу бакалавров в Иннополис. А с тезисами на основе диплома поедет на международную мультиконференцию по биоинформатике регуляции и структуры геномов / системной биологии (BGRS/SB-2026) в июле! Поздравляем Ксению! Алгоритм, который помогает расшифровывать язык клеток и приближает нас к пониманию тяжёлых болезней, — это действительно важно 🔬