Кажется, мы нашли одну из самых дорогих задач в вычислительной биологии! Представьте бе... — 31 июля 2026 г. в 11:04:24.373
Кажется, мы нашли одну из самых дорогих задач в вычислительной биологии! Представьте белок в капле воды. Это десятки, а иногда и сотни тысяч атомов. Теперь представьте, что компьютеру нужно понять, как каждый атом взаимодействует со всеми остальными. Если считать все пары честно, количество вычислений растет настолько быстро, что даже современным суперкомпьютерам пришлось бы несладко. Поэтому ученые придумали математические хитрости. 🎥 На видео показан один из самых красивых примеров — метод Particle Mesh Ewald (PME). Вместо того чтобы бесконечно перебирать пары атомов, алгоритм переносит часть вычислений на трехмерную сетку и выполняет их в так называемом пространстве Фурье. После этого результат возвращается обратно к атомам. Именно этот подход сделал моделирование больших биомолекул практически возможным. За каждой красивой анимацией белков скрываются не только биология и химия, но и изящные математические алгоритмы, без которых современная молекулярная динамика просто не существовала бы. Подробнее о том, как физика, математика и информатика помогают рассчитывать поведение миллионов атомов, читайте в нашей новой статье. #Биомолекула_Инфографика — синхронизировано TG-MAX Sync