Мы постоянно рассказываем про биологию. Но на самом деле все мы понимаем, что науки о ж... — 28 июля 2026 г. в 08:02:46.162
Мы постоянно рассказываем про биологию. Но на самом деле все мы понимаем, что науки о жизни невозможны без физики, математики и информатики. Поэтому не пугайтесь. И да, сегодня будут формулы. 😄 Именно так — с помощью уравнений движения, численных методов и алгоритмов — ученые заставляют двигаться виртуальные молекулы. Для этого используются специальные математические схемы, которые рассчитывают, где окажется каждый атом через невероятно короткий промежуток времени — всего 1–2 фемтосекунды (10⁻¹⁵ секунды). После этого расчет повторяется. Много-много раз! Чтобы смоделировать всего одну микросекунду жизни белка, компьютеру приходится выполнить около миллиарда таких шагов. А если выбрать шаг слишком большим, модель попросту… «взорвется»: атомы начнут двигаться неестественно быстро и разлетятся в разные стороны. На иллюстрации — две самые известные схемы интегрирования, Verlet и Leap-frog. Именно такие алгоритмы лежат в основе большинства современных программ для молекулярной динамики. За каждой красивой анимацией белков скрываются не только биология и химия, но и огромный пласт вычислительной математики. И именно об этом мы подробно рассказываем в новой статье спецпроекта «Молекулярная динамика». #Биомолекула_Инфографика