Перейти к содержимому
Максиметер

Белковые языковые модели (БЯМ) для каждой позиции белка вычисляют вероятности всех 20 а...

Белковые языковые модели (БЯМ) для каждой позиции белка вычисляют вероятности всех 20 аминокислот. Если модель уверенно предсказывает один остаток — позиция считается консервативной и её изменение нежелательно; если вероятности распределены между несколькими аминокислотами, здесь допустимы замены. На основе этих вероятностей формируется карта толерантности, показывающая, какие участки белка можно мутировать без потери функции. На примере харибдотоксина — пептида из яда скорпиона Leiurus quinquestriatus — видны консервативные цистеиновые остатки (обозначенные С), образующие дисульфидные связи, которые критичны для стабильности токсина. Далее такую карту можно использовать для целенаправленного проектирования белков с заданными свойствами, подбирая замены в менее консервативных зонах. 🔬 Факты

2 просмотров

Другие публикации канала

Популярные публикации канала

Читать дальше

Два раза в неделю свежие посты этого канала — на почту и в личную ленту. Без повторного поиска канала вручную.