Что такое вторая диагональ на HiC-картах? — 4 сентября 2026 г. в 07:03:26.052
Что такое вторая диагональ на HiC-картах? Вторая диагональ на Hi-C-карте — это дополнительная полоса повышенной частоты контактов, расположенная дальше от основной диагонали, которая соответствует контактам между близкими участками хромосомы. Такая структура может возникать, если хроматин организован в более крупную спиральную структуру: участки, удаленные друг от друга по линейной последовательности ДНК, оказываются пространственно сближены повторяющимся образом. Другими словами эта та самая двойная спираль, отображенная на Hi-C-карте. У многих растений гигантский геном, который может быть в десятки раз больше человеческого. Тогда на Hi-C-картах обнаруживаются дополнительные диагональные структуры, которые могут отражать спиральную организацию хроматина на нескольких уровнях. «У растений, особенно с супердлинным геномом, есть вторая диагональ, а иногда и третья, когда спираль закручивается еще раз в спираль. Это какая-то частная история. Понятно, что если у вас супердлинные хромосомы, их надо как-то упаковать». Этот феномен заинтересовал Наримана Баттулина после того, как похожие структуры обнаружили в данных по подсолнечнику. Исследователь решил проверить гипотезу на растении с особенно крупными хромосомами — вороньем глазе. Растение ученый выкопал в лесу недалеко от дома, теперь оно растет в горшке и ждет своего часа, ведь Hi-C для такого огромного генома требует слишком больших затрат, поскольку объем и стоимость анализа существенно возрастают с увеличением размера генома. Полное интервью с Нариманом Баттулиным — о 3D-геномике, Hi-C, ТАДах, генетически модифицированных мышах и неожиданных открытиях — в спецпроекте «Биология в России: люди и открытия». Проект реализуется при поддержке Министерства науки и высшего образования Российской Федерации в рамках инициативы «Десятилетие науки и технологий». Партнером проекта выступила компания BioinnLabs. #Биомолекула_БиологияВРоссии