Репрограммированные стволовые клетки (ИПСК) позволяют получать нейроны конкретого пацие...
Репрограммированные стволовые клетки (ИПСК) позволяют получать нейроны конкретого пациента: это мощный инструмент для изучения болезней мозга. Но насколько точно такие нейроны воспроизводят реальные клетки мозга? Междисциплинарная команда с участием генерального директора ФНКЦ ФХМ им. Лопухина, член-корреспондента РАН М.А. Лагарьковой объединила новые Hi-C данные (метод картирования пространственной организации ДНК) из нейронов, полученных из ИПСК, и нейронов, взятых посмертно из человеческого мозга, а также опубликованные ранее наборы данных. Всего в исследовании рассматривались 228 образцов мозга человека и 89 мышиных образцов разных подтипов клеток. Всё это свели в 96 карт высокого покрытия и проанализировали организацию хроматина - от компартментов и TAD-доменов до петель ДНК и Polycomb-опосредованных контактов. Главные выводы: 🔹 Нейроны из ИПСК во многом сохраняют хроматиновое состояние недифференцированных клеток и больше похожи на фетальные, чем на зрелые нейроны. 🔹 У них необычно сильная компартментализация, а гены развития обогащены на границах TAD-доменов; 🔹 Заметно снижено число дальних репрессивных Polycomb-контактов, которые обычно «выключают» ранние фетальные программы; 🔹 Несмотря на незрелость, такие нейроны удобны для изучения взаимодействий болезнетворных SNP с генами-мишенями — особенно при психиатрических расстройствах, имеющих нейроразвитийные корни. 📎 Статья вышла в журнале Genome Research (издательство Cold Spring Harbor Laboratory Press).