Индикатор холодовой цепи на основе ДНК, но не более.
Индикатор холодовой цепи на основе ДНК, но не более. Недавно Корейский передовой институт науки и технологий (KAIST) представил результаты (Nature), как они синтезируют ДНК, подбирая только температурный режим. То есть просто меняя температуру, можно синтезировать ДНК в нужной последовательности! Но на презентации они сделали индикаторы температуры и всё. Заявляется, что это идеально (и не дорого - стикер якобы по цене в 1 USD) для отслеживания клинических образцов в экспедициях, для мониторинга условий хранения дорогостоящих клеточных препаратов на всех этапах логистики. Звучит скучно. Неужели не получился новый ПЦР? Новый способ синтеза ДНК? Что-то более крутое? Разбираемся. ***(для специалистов)*** 1. Каждый нуклеотид - на своей ДНК-шпильке. 2. Разная температура активирует разные шпильки - градиент температур от 20 до 60°C с шагом 10. В этом вся суть. 3. Синтезирует ДНК Bst-полимераза (а не обычная Taq), и она не просто копирует, но раздвигает нить ДНК, вытесняя шпильку, так что после смены температуры может присоединиться новая шпилька с другим нуклеотидом. Отсюда возможность программировать последовательность ДНК просто режимом температуры. 4. Температурный режим от 18 до 64°С. Если температура слишком низкая - фермент работает медленно. Если слишком высокая (80°C) - он денатурирует и погибает. 5. Чтобы записать 10 бит данных или увидеть цвет, нужны часы инкубации. Авторы пишут, что сокращение времени воздействия температуры до 15 минут резко снижает точность 6. Эффективность полимеразы на каждом шаге ~96.45%, что ведет к накоплению ошибок. Для записи 10 бит точность падает до ~60% 7. Длинный архив записи температур по цвету легко спутать (цвета смешаются), надо секвенирование! 8. Для работы при температуре тела или 4°C (холодильник) нужно перепроектировать шпильки. Авторы говорят, что это возможно, но это работа на перспективу.