Перейти к содержимому
Максиметер

Для тех, кто осилил карточки, но в силу более продвинутых компетенций имеет мозг, алчущ...

Для тех, кто осилил карточки, но в силу более продвинутых компетенций имеет мозг, алчущий доп.деталей, ниже приведен развернутый текст новости. Там много неразжеванной для обывателя терминологии и нудных цифр. Но если вам в жилу — читайте. 👇 Итак, исследователи из Стэнфордского университета* и Arc Institute впервые получили жизнеспособные бактериофаги из полных геномов, созданных генеративным ИИ. Вирусный код наконец запустился не в переносном (знакомом айтишникам) смысле. А буквально. *Признан нежелательной организацией в РФ. Дообученные примерно на 15 000 геномах Microviridae модели Evo 1 и Evo 2 (про них мы уже писали в этом паблике) получили затравки длиной всего 4–9 нуклеотидов из начала генома ΦX174 и выдали около 700 000 вариантов. Вычислительная фильтрация оставила 302 кандидата, 285 удалось синтезировать, после чего их ДНК внесли в непатогенные лабораторные клетки E. coli C. Только 16 геномов, или 5.6%, дали размножающиеся фаги, способные разрушать бактерии и заражать следующие клетки, — у генеративного изобилия нашёлся беспощадный рецензент по имени «эксперимент». Девять фагов сохранили исходные последовательности моделей, а у семи после запуска в бактериях появились дополнительные мутации — патч первого дня добрался и до синтетической биологии. Каждый жизнеспособный фаг содержал от 67 до 392 изменений относительно ближайшего природного родственника, причём у 13 были мутации, не обнаруженные в изученных природных последовательностях. Некоторые варианты размножались успешнее или лизировали клетки быстрее природного ΦX174. Коктейль из 16 созданных фагов за один–пять последовательных пассажей преодолел устойчивость всех трёх линий E. coli, невосприимчивых к ΦX174, тогда как смесь природных родственных фагов с задачей не справилась. При этом новые фаги сохранили узкую специализацию: они росли на E. coli C и родственном штамме W, но не размножались на шести других проверенных штаммах. Однако ΦX174 — крошечный вирус с геномом из 5386 нуклеотидов, а испытания ограничились лабораторными бактериями, поэтому перед нами не готовая терапия и не доказательство способности ИИ проектировать сложные вирусы человека. Работа намечает путь к созданию фаговых препаратов против устойчивых бактерий, но заодно превращает биобезопасность из примечания мелким шрифтом в обязательную часть технического задания. King S. H. Generative design of bacteriophages with genome language models / S. H. King, C. L. Driscoll, D. B. Li [et al.] // Science. — 2026. — Vol. 393, no. 6811. — Art. eaec2657. — DOI: 10.1126/science.aec2657. — URL: https://www.science.org/doi/10.1126/science.aec2657

556 просмотров

Канал в каталоге Максиметера

2 595 подписчиков · Образование

Другие публикации канала

Популярные публикации канала

Читать дальше

Два раза в неделю свежие посты этого канала — на почту и в личную ленту. Без повторного поиска канала вручную.